m6A研究又有新手段了?趕緊來(lái)了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開(kāi)發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開(kāi)發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專(zhuān)門(mén)進(jìn)行分析(圖3)。動(dòng)物疾病模型還為科研人員提供了研究人類(lèi)疾病的跨學(xué)科方法。山西兔科研技術(shù)服務(wù)分離

應(yīng)退回純酒精中重新脫水,然后再透明,否則切片難以鏡檢。(4)二甲苯應(yīng)盡量保持無(wú)水,應(yīng)經(jīng)常更換,或用紗布包無(wú)水硫酸銅放入染色缸內(nèi)吸收水分。5.透蠟注意事項(xiàng)(1)透蠟的目的是除去組織中的透明劑(如二甲苯等),使石蠟滲透到組織內(nèi)部達(dá)到飽和程度以便包埋。透蠟時(shí)間根據(jù)組織大小而定。(2)盡量保持在較低溫度中進(jìn)行,以石蠟不凝固為度。(3)透蠟溫度要恒定,不可忽高忽低。(4)操作要迅速,力求在短的時(shí)間內(nèi)完成石蠟透入過(guò)程,以免引起組織變硬、變脆、收縮等。(5)注意溫度不要過(guò)高,以免組織發(fā)脆。6.染色水洗注意事項(xiàng)(1)染色原理:伊紅主要染細(xì)胞質(zhì),著色濃淡應(yīng)與蘇木精染細(xì)胞核的濃淡相配合,如果細(xì)胞核染色較濃,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)濃染,以獲得鮮明的對(duì)比。(2)染色時(shí)間應(yīng)根據(jù)染色劑的成熟程度及室溫高低,適當(dāng)縮短或延長(zhǎng)。室溫高時(shí)促進(jìn)染色,染色時(shí)間可短些,否則可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間,冬季室溫低時(shí)可放入恒溫箱中染色。(3)注意流水不能過(guò)大,以防切片脫落。(4)如果細(xì)胞核染色較淺,細(xì)胞質(zhì)也應(yīng)淡染??稍谝良t乙醇液中滴加數(shù)滴冰醋酸助染,促使細(xì)胞質(zhì)容易著色,并且經(jīng)乙醇脫水時(shí)不易褪色。廣西病理科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)常見(jiàn)的5種實(shí)驗(yàn)動(dòng)物取血方式,你掌握幾種?

在人類(lèi)疾病研究中數(shù)據(jù)表明,常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類(lèi):自發(fā)性動(dòng)物模型、誘發(fā)型動(dòng)物模型、遺傳工程動(dòng)物模型、生物醫(yī)學(xué)動(dòng)物模型和陰性動(dòng)物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發(fā)性動(dòng)物模型:是指動(dòng)物未經(jīng)任何有意識(shí)的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產(chǎn)生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動(dòng)物模型:亦稱(chēng)實(shí)驗(yàn)性動(dòng)物模型。是使用物理、化學(xué)或生物致病因素誘導(dǎo)動(dòng)物產(chǎn)生某些類(lèi)似人類(lèi)疾病表現(xiàn)而制備的動(dòng)物模型。此模型具有制備方法簡(jiǎn)單,實(shí)驗(yàn)條件容易控制,重復(fù)性好等特點(diǎn),廣泛應(yīng)用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機(jī)制的研究。3、遺傳工程動(dòng)物模型:是利用遺傳工程技術(shù)對(duì)動(dòng)物基因組進(jìn)行修飾,用于研究基因功能或疾病機(jī)制的動(dòng)物模型。也稱(chēng)基因修飾動(dòng)物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術(shù)有目的的干預(yù)動(dòng)物的遺傳組成,導(dǎo)致動(dòng)物出現(xiàn)新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學(xué)研究的和其他目的所用的動(dòng)物模型。4、生物醫(yī)學(xué)動(dòng)物模型:也是指利用健康生物的特定生物學(xué)特征,研究人類(lèi)疾病相似表現(xiàn)得模型。這類(lèi)動(dòng)物模型與人類(lèi)疾病存在一定的差異,研究者應(yīng)加以比較,從中獲得有關(guān)材料。
如胰腺,一般取胰島較多的胰腺尾部;肺應(yīng)取有細(xì)支氣管及帶有軟骨片的小支氣管部。如果實(shí)驗(yàn)需進(jìn)行多樣本的采集,采集順序應(yīng)按照:消化,神經(jīng)系統(tǒng),皮膚,肌肉等的順序進(jìn)行。選好塊的切面。熟悉某些成分安排,然后決定其切面的走向;如一長(zhǎng)管狀以橫切面較好。切除不需要的部分。特別是周?chē)闹镜?,?yīng)盡可能掉,否則給固定、脫水、浸蠟、切片等帶來(lái)一些不必要的問(wèn)題。樣品的固定(1)固定的方法:①小塊固定法:從動(dòng)物取下的小塊,立即置入液態(tài)固定劑(這是應(yīng)用經(jīng)常的方法)。②注射/灌注固定法:某些塊由于體積過(guò)大或固定液極難滲入內(nèi)部或需要對(duì)整個(gè)臟器或整個(gè)動(dòng)物進(jìn)行固定,這時(shí)宜采用注射固定法,將固定液注入血管,經(jīng)血管分支到達(dá)整個(gè)和全身,從而得到充分的固定。另,空腔比如肺,肺內(nèi)含有空氣,固定液難以滲入,建議先做肺灌注,使得肺充盈滿固定液以后再進(jìn)行保存,如果空腔中氣體沒(méi)有排出,后續(xù)可能影響固定效果(沒(méi)有灌注的肺會(huì)浮在液體表面不利于固定,切片以后也會(huì)看到很多的空泡)。③蒸汽固定法:比較細(xì)小而薄的標(biāo)本,可用鋨酸或甲醛蒸汽固定。主要用于血液或細(xì)胞涂片以及某些薄膜的固定。。瘤細(xì)胞的增殖活性,從而更好地評(píng)估腫、瘤的惡性程度和預(yù)后.

啟醫(yī)療,個(gè)體化用藥貝克曼庫(kù)爾特細(xì)胞專(zhuān)題--助力病毒載體純化、細(xì)胞特性分析產(chǎn)品庫(kù)儀器設(shè)備耗材試劑抗體技術(shù)服務(wù)生物芯片芯片掃描儀|芯片點(diǎn)樣儀|生物芯片系統(tǒng)|生物芯片|其它測(cè)讀系統(tǒng)洗板機(jī)|多功能篩選系統(tǒng)|大型分析系統(tǒng)|化學(xué)發(fā)光檢測(cè)儀|分光光度計(jì)|其它|光譜系統(tǒng)原子吸收光譜儀|可見(jiàn)光光譜儀|熒光光譜儀|紅外光譜儀|近紅外光譜儀|LIBS光譜儀|拉曼光譜儀|紫外/可見(jiàn)/近紅外光譜儀|其它分子生物實(shí)驗(yàn)儀器電泳設(shè)備|紫外設(shè)備|普通PCR儀|定量PCR儀|數(shù)字PCR儀|DNA/有機(jī)/多肽合成|轉(zhuǎn)基因儀|其它顯微系統(tǒng)倒置顯微鏡|實(shí)體顯微鏡|生物顯微鏡|電子顯微鏡其它顯微鏡|顯微操縱|附件和濾光片|其它色譜系統(tǒng)液相色譜系統(tǒng)|制備液相色譜系統(tǒng)|毛細(xì)管LC系統(tǒng)氣相色譜系統(tǒng)|離子色譜系統(tǒng)|色譜系統(tǒng)檢測(cè)器樣品管理工具|色譜系統(tǒng)附件質(zhì)譜系統(tǒng)飛行質(zhì)譜|四極桿質(zhì)譜|離子阱質(zhì)譜|等離子質(zhì)譜|毛細(xì)管電泳/質(zhì)譜聯(lián)用系統(tǒng)|雜交質(zhì)譜|質(zhì)譜標(biāo)準(zhǔn)品|其它實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化氨基酸分析系統(tǒng)|蛋白純化系統(tǒng)|蛋白質(zhì)翻譯系統(tǒng)|全自動(dòng)分液系統(tǒng)|核酸提取純化全自動(dòng)血液采樣系統(tǒng)|基因組/蛋白組設(shè)備DNA測(cè)序儀|全基因組測(cè)序儀|基因分型系統(tǒng)|雙向電泳系統(tǒng)|蛋白質(zhì)純化|蛋白質(zhì)斑點(diǎn)切取系統(tǒng)|其它神經(jīng)生物學(xué)儀器動(dòng)物功能檢測(cè)設(shè)備|動(dòng)物處理設(shè)備|。實(shí)驗(yàn)干貨 | 分子克隆實(shí)驗(yàn)——無(wú)縫克隆。天津乳鼠科研技術(shù)服務(wù)分離
動(dòng)物疾病模型可以分為兩種類(lèi)型:自然模型和人工模型。山西兔科研技術(shù)服務(wù)分離
m6A修飾圖譜構(gòu)建及作用機(jī)制:通過(guò)m6A甲基化測(cè)序(MeRIP-Seq,miCLIP)構(gòu)建疾病細(xì)胞模型或者發(fā)病組織的m6A修飾譜,分析m6A的motif,peaks數(shù)量及分布,Peak關(guān)聯(lián)基因的特征,聯(lián)合RNA-seq研究m6A甲基化與表達(dá)的關(guān)系。m6A研究思路方案一方案二研究案例1、.(IF=)為研究ALKBH5的m6A作用機(jī)制,作者利用芯片和m6A-seq篩選到膠質(zhì)瘤增殖相關(guān)的FOXM1,通過(guò)qPCR、WB、免疫熒光、核質(zhì)分離WB/qPCR、RIP和MeRIP等實(shí)驗(yàn)證明ALKBH5通過(guò)去甲基化調(diào)節(jié)FOXM1在GSCs中的表達(dá)。為研究ALKBH5對(duì)FOXM1的作用是否受其他因子的調(diào)節(jié),作者研究了FOXM1的鄰近基因,發(fā)現(xiàn)lncRNAFOXM1-AS與FOXM1序列互補(bǔ),且共表達(dá)、共定位,進(jìn)一步通過(guò)RIP,RNApulldown等實(shí)驗(yàn)證明lncRNAFOXM1-AS促進(jìn)ALKBH5和FOXM1初級(jí)轉(zhuǎn)錄本的相互作用。通過(guò)細(xì)胞實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證ALKBH5在lncRNAFOXM1-AS的作用下維持FOXM1的表達(dá)和細(xì)胞增殖,從而維持GSCs的干性。圖3ALKBH5敲除細(xì)胞中m6A修飾的特征和基因表達(dá)的變化2、RNAN6-methyladenosinemethyltransferaseMETTL3promoteslivercancerprogressionHepatology,2017.(IF=)表觀遺傳改變極大地促進(jìn)了人類(lèi)癥的發(fā)生。傳統(tǒng)的表觀遺傳研究主要集中在DNA甲基化,組蛋白修飾和染色質(zhì)重構(gòu)。近。山西兔科研技術(shù)服務(wù)分離